进口货物选择在进口时进入综合保税区的主要原因有以下几点：

延迟缴税优势： 进口货物进入综合保税区后，可以暂时延迟缴纳进口关税和增值税。在货物离开保税区进入国内之前，无需缴纳税款，有利于提高资金周转率。

免税存储： 进口货物在综合保税区内暂存期间通常是免税的，无需缴纳进口关税和增值税。这降低了货物的存储成本，并在一定程度上提高了企业的竞争力。

灵活的供应链管理： 进口货物在综合保税区内可以进行分拨、加工、组装等灵活的供应链管理操作，根据市场需求和订单情况灵活调整货物的处理方式，提高了供应链的灵活性和响应速度。

简化通关手续： 进口货物进入综合保税区后，报关和通关手续相对较简化，加快了货物的通关速度，降低了通关成本。

提高管理效率： 综合保税区通常配备有完善的仓储设施和物流管理系统，能够提高货物的管理效率和安全性，降低货物损失和遗失的风险。

综合保税区为进口货物提供了一种灵活、便捷的贸易环境，通过延迟缴税、免税存储等优势，降低了企业的贸易成本，提高了资金利用效率，促进了国际贸易的发展。因此，许多进口企业会选择将货物进入综合保税区进行处理和管理。