首先，保税区是一个国家或地区设置的、经海关批准注册并受海关监督管理的可以较长时间存储商品的区域。它也被称作保税仓库区。在中国的保税区，运入保税区的货物可以进行储存、改装、分类、混合、展览，以及加工制造，外国货物可以在保税区与境外之间自由进出，但如果要进入关境则需要交纳关税。

其次，各个保税区的地理位置也不同。自贸试验区是现有保税区的合并。此外，保税区级别低于综合保税区。两者的区别主要体现在保税区是进口入区保税、国内产品入区不退税，离境退税，而综合保税区则具有更多的优惠政策。

另外，不同的保税区也有不同的功能。例如，保税物流园区主要功能是国际物流、检测维修和展示，而出口加工区则主要是为了加工贸易而存在。这些海关特殊监管区域都有保税的功能，除此之外，每一个区域还有不同的侧重点。

各个保税区之间存在一些区别，主要体现在地理位置、级别和功能等方面。