综合保税区实行封闭式管理，围网封闭，需要设置专门的卡口、围网设备和相应的视频监控设备等。

在综合保税区与境外之间进出货物管理方面，国家禁止进口、出口的货物、物品不得在综合保税区与境外之间进、出。但是法律法规另有规定的除外。

综合保税区与境外之间进出的货物不实行关税配额、许可证件管理，但法律法规、我国缔结或者参加的国际条约、协定另有规定的除外。

境外进入综合保税区的货物及其外包装、集装箱，应当由海关依法在进境口岸实施检疫。因口岸条件限制等原因，海关可以在区内符合条件的场所（场地）实施检疫。综合保税区运往境外的货物及其外包装、集装箱，应当由海关依法实施检疫。

综合保税区与境外之间进出的交通运输工具，由海关按照进出境交通运输工具有关规定实施检疫。