综合保税区仓库和普通仓库在功能上存在一些区别，主要体现在以下几个方面：

服务对象不同：综合保税区仓库的服务对象主要是区内企业，而普通仓库的服务对象则更为广泛，可以为企业或个人提供仓储服务。

功能不同：综合保税区仓库的功能相对于普通仓库更加丰富，包括保税仓储、一般仓储、物流配送、电商进口、跨境电商等多种功能。

贸易方式不同：综合保税区仓库主要是为区内企业提供保税仓储服务，而普通仓库则可以为企业提供一般贸易仓储服务。

 管理模式不同：综合保税区仓库的管理模式相对于普通仓库更加严格，需要遵守相关的法律法规和规定，包括海关监管、检验检疫等。

总的来说，综合保税区仓库和普通仓库在功能、服务对象、贸易方式和管理的模式上存在一些区别，主要体现在服务范围、服务要求和管理的严格程度等方面。