“保” 是指保税政策。从境外入区的货物，暂缓缴纳进口关税及进口环节税，企业可以根据将来货物流向再决定是否征税进口。保税政策是综合保税区基本、核心的税收政策，区内保税加工、保税物流、保税服务等业务普遍适用该政策。

“免” 是指免税政策。第一，境外进口入区环节，区内基建项目所需物资、生产所需设备及零部件、办公所需合理数量的用品，除另有规定外，免予征收进口关税和进口环节税。第二，区内、区间流转环节，不征收货物国内环节增值税和消费税。第三，从区内运往境外的货物免征出口关税，但法律、行政法规另有规定的除外。
 

“退” 是指退税政策 。从境内区外出口入区的货物，除另有规定外，予以国内环节增值税、消费税出口退（免）税。

在税收管理方面，基于封闭围网的监管条件，海关对综合保税区实行较为宽松的监管制度，如对区内货物不实行担保管理、对区内加工贸易货物不实行单耗标准管理、不设货物仓储期限等。